28日，台湾《联合晚报》报道，台湾前“立法委员”邱毅当天在台湾所谓“立法院”举行记者会，会上邱毅说，蔡英文曾在1999年向当时的台湾所谓“国安局”写信要求拨款研究“特殊国与国关系”。邱毅说：”两国论不就是李（登辉）蔡（英文）合谋的杰作吗？“直接指责蔡英文是“两国论”的始作俑者。

　　报道称，前国民党“立委”邱毅指出，民进党“总统”候选人蔡英文在1999年8月16日，写了一封信给当时的“国安局长”丁渝洲，希望丁给蔡262万元说要进行研究，隔天这笔钱就下来了。邱毅说，蔡英文要求这笔钱就是为了研究“特殊国与国关系”，这不是两国论是什么？“两国论不就李(李登辉)蔡合谋的杰作吗？”

　　邱毅批评，蔡英文说谎成性，被问炒地皮就推给爸爸，被问到两国论就推给李登辉，从没看过“要选‘总统’的人这么没担当”。邱毅并指，蔡英文写信给丁渝洲要262万，说要做研究，邱并拿出“收据”，指这笔钱在隔天8月17日就下来了，就是所谓的“816项目”。

　　邱毅说，蔡英文每次被问到两国论，都推给李登辉，但蔡英文的研究计划，就为了研究“特殊国与国关系”，“这不是两国论是什么？”邱毅并质疑，1991年“国安局”已经“法制化”，蔡英文为什么不经过正常请款程序？这其中有没有违反“政府采购法”？

　　邱毅说，为何李登辉、蔡英文关系密切到只有一封信，就能向“国安局长”要到262万？并批评蔡英文公开说谎，“两国论不就李蔡合谋的杰作吗？蔡英文不要什么都推给李登辉。”

　　据报道，蔡英文是“两国论”始作俑者的说法并非邱毅首先提出，早在今年8月，台湾“总统府”发言人陈以信就曾表示，1999年李登辉提出“两国论”时，始作俑者就是蔡英文，并称当时的整个过程都是“黑箱作业”。

　　据悉，1999年时蔡英文担任“国家统一委员会”的“研究委员”，一直被指责在李登辉推出“两国论”过程中扮演了重要角色。