全球约450家孔子学院中，有15家是在德国。就在美国和葡萄牙等抗议孔子学院的同时，德国却并没有出现类似的抗议活动。就孔子学院日，《世界报》发表了一篇调查报道。

　　《世界报》指出，与德国歌德学院不同的是，孔子学院不是独立机构，而通常是挂在东道主国家某大学的名下。双方共同出资经营。大学教授常常既是汉学系的教授，又是孔子学院的领导。批评者因此批评说，外国大学的独立性受到了中国官方的威胁。受威胁民族协会亚洲部负责人德里尤斯表示：“这对学术教学的独立性不是个好征兆。”但德国身处其境的教授却认为，这一威胁并不存在，因为学术性的汉学系与以传播中国文化和语言为主的孔子学院是分开的。比如，纽伦堡－爱尔兰根大学汉学系教授耐克纳便表示，“我的教授职位是绝对自由的。”柏林孔子学院也表达了类似的看法。

　　在问到为什么德国人没有发起抗议时，路德维希东亚学院的鲁道夫表示，汉学家受到来自中国的潜在压力，因此会首先自我审查把关。因为批评文章会影响作者与中国的关系，比如拿不到中国签证等。但也有专家不赞同这一观点。

　　德国媒体不时发表有关孔子学院成功的报道。弗莱堡大学校长日前向《巴登日报》表示，弗莱堡孔子学院5年来的实验是成功的，它在两个体系之间搭建了桥梁。该孔子学院的经济来源是：弗莱堡市支付大部分租金。弗莱堡大学派遣学院领导人并支付其薪水。学院举办节目费用和其余工作人员的薪水则由中方承担。