鑑于大陆船只在钓鱼台附近海域航行已成常态，日本海上保安部在范围内动员巡逻船及工作人员维持警戒态势，据有关人员介绍：『目前工作在第一线的人员已极度疲劳』。第11管区海上保安总部的一名工作人员表示：『不知道事态何时才能平息，易对常规的工作产生负面影响』。

　　根据中新网报导，日本海上保安总部约有1.26万名工作人员及121艘巡逻船，共分11个管区，各设有海上保安总部，负责海上救助、取缔偷渡及进行海洋污染调查等。报导称，负责钓鱼岛附近海域的第11管区拥有9艘巡逻船，因仅此远远不够，已从全国各地调集船只，现有约30艘巡逻船集中力量。

　　但是，各地支援第11管区的负面影响已然显现。第1管区(北海道小樽)和第4管区(名古屋)因巡逻船不够，取消了原定于9月下旬进行的一般公开训练及航海体验活动。第10管区(鹿儿岛)也取消了原定10月中旬举行的综合训练计划。

　　此外，各地近来频发大的船舶事故。第7管区的长崎县海域9月19日发生货轮火灾事故。第2管区的宫城县海域9月24日也发生撞船事故，巡逻船赶到距宫城县约900公里处的出事地点，对失踪的13人展开搜救。据某管区干部透露，『船只和人员数量本来就不充裕，派船去支援后，本管区事故增加时就很难应对』。